Os resíduos de saúde gerados no hospital e na UPA são destinados de acordo com a sua classificação. Os Resíduos de Serviços de Saúde (RSS) são retirados, transportados, tratados e efetuado sua disposição final através de uma empresa habilitada e qualificada. Os materiais recicláveis são coletados através de uma empresa de reciclagem do município, as lâmpadas são entregues para as empresas especializadas reduzindo assim o impacto ambiental e trabalhando na logística reversa.